Análisis bioinformático de la proteasa ClpP de Streptococcus mutans asociada a la formación de caries dental humana

Malú Chavez-Gamarra, Gustavo A. Sandoval

Resumen


Objetivo: Realizar el análisis bioinformático de la proteasa ClpP de Streptococcus mutans relacionada con su tolerancia al estrés químico durante la formación de caries dental humana. Material y métodos: Para llevar a
cabo este análisis se ha empleado la secuencia aminoacídica de la proteasa ClpP de S. mutans cepa UA159 obtenida a partir de la base de datos del GenBank (código de accesión Q8DST7.1), la cual fue utilizada para la determinación de sus parámetros bioquímicos, dominios conservados, predicción de estructuras secundarias y modelamiento por homología, empleando las herramientas bioinformáticas ProtParam, Prosite, PHD Secondary Structure Prediction y SWISS-MODEL, respectivamente. La visualización de modelos tridimensionales se realizó empleando PyMol. Resultados: La proteasa ClpP de S. mutans es una molécula ácida y de mediano peso molecular y además presenta dos dominios altamente conservados relacionados con endopeptidasas bacterianas. A partir de la predicción de su estructura tridimensional, la proteasa ClpP presenta
una conformación tetradecamérica similar a un anillo, por el cual pasarían las proteínas bacterianas que necesiten ser procesadas. Conclusión: La proteasa ClpP de S. mutans resulta importante para el proceso infectivo de esta bacteria lo cual permitirá generar una variedad de estrategias para la inhibición de la
colonización de la cavidad bucal.


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DOI: http://dx.doi.org/10.21679/arc.v1i2.29

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