Caracterización in silico de la proteína Dpr de Streptococcus mutans asociada a la formación de caries dental humana

Malú Chavez-Gamarra, Gustavo A. Sandoval

Resumen


Objetivo: Realizar la caracterización in silico de la protína Dpr de Streptococcus mutans relacionada con su tolerancia al daño oxidativo durante la formación de caries dental humana. Material y métodos: Para llevar a cabo esta caracterización se ha empleado la secuencia aminoacídica de la proteína Dpr de S. mutans cepa GS-5 obtenida a partir de la base de datos del GenBank (código de accesión BAA96472.1), la cual fue utilizada para la determinación de sus parámetros bioquímicos, dominios conservados, predicción de estructuras
secundarias y modelamiento por homología, empleando las herramientas bioinformáticas ProtParam, Prosite, PHD Secondary Structure Prediction y SWISS-MODEL, respectivamente. La visualización de modelos tridimensionales se realizó empleando PyMol. Resultados: La proteína Dpr de S. mutans es una molécula ácida y de bajo peso molecular y además presenta un dominio altamente conservado involucrado en la unión al hierro. A partir de la predicción de su estructura tridimensional, la proteína Dpr presenta una conformación dodecamérica que estaría implicada en su alta afinidad por hierro así como por otros iones divalentes. Conclusión: La proteína Dpr de S. mutans resulta importante para el proceso infectivo de esta bacteria la cual debe generar una variedad de estrategias para la inhibición de la colonización de la cavidad bucal.


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DOI: http://dx.doi.org/10.21679/arc.v1i1.28

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